În subordinea Ministerului Transporturilor funcționează următoarele entități:
- Publicitate -
- 15 spitale clinice căi ferate, finanțate din venituri proprii prin sistemul de asigurări sociale de sănătate;
- 3 instituții publice finanțate integral de la bugetul de stat;
- 4 instituții publice finanțate din venituri proprii și din subvenții de la bugetul de stat;
- 7 instituții publice finanțate integral din venituri proprii.
Sub coordonarea și autoritatea Ministerului Transporturilor se află 25 de operatori economici din sectorul feroviar, rutier, naval și aerian.
